Важливу роль у організації освітнього процесу відіграють циклові комісії, які є основною ланкою в розробці та запровадженні прогресивних форм і методів навчання та виховання.
З метою підвищення науково-педагогічного потенціалу педагогічного колективу коледжу, відповідно до вимог Закону України «Про фахову передвищу освіту» в коледжі створено чотири циклові комісії, роботу яких очолюють голови циклових комісій – досвідчені викладачі.
Робота циклових комісій організована відповідно до Положення про циклову комісію у ВСП «Аграрно-економічний фаховий коледж ПДАУ»